Σε πρώτη φάση στο παιχνίδι μπήκε η Ειδική Υπηρεσία Εφαρμογής Παρεμβάσεων Αγροτικής Ανάπτυξης και η Ειδική Υπηρεσία Εφαρμογής Άμεσων Ενισχύσεων και Τομεακών Παρεμβάσεων για να αναλάβουν μέρος των δράσεων του ΟΠΕΚΕΠΕ για τις πληρωμές μέτρων/υπομέτρων/δράσεων του ΠΑΑ 2014-2020.
Όπως αναφέρεται σε απόφαση που υπέγραψε ο υπουργός Αγροτικής Ανάπτυξης και Τροφίμων, Γιώργος Γεωργαντάς η ανάθεση των αρμοδιοτήτων του ΟΠΕΚΕΠΕ σε άλλους φορείς είναι:
1. Για τα μέτρα/υπομέτρα/δράσεις του Προγράμματος Αγροτικής Ανάπτυξης της Ελλάδας 2014-2020 (ΠΑΑ 2014 – 2020) του Παραρτήματος I της παρούσας, τον έλεγχο των δικαιολογητικών των αιτήσεων πληρωμής βάσει της διαδικασίας Ι.6.4 του Συστήματος Διαχείρισης και Ελέγχου (ΣΔΕ) του ΠΑΑ 2014-2020 (Β’ 1273/2016) και την έγκριση (αναγνώριση και εκκαθάριση) των πληρωμών, για τη χρηματοδότηση των νομικών δεσμεύσεων των δικαιούχων, αναλαμβάνει η Ειδική Υπηρεσία Εφαρμογής Παρεμβάσεων Αγροτικής Ανάπτυξης.
2. Για τα μέτρα/υπομέτρα/δράσεις του Προγράμματος Αγροτικής Ανάπτυξης της Ελλάδας 2014-2020 (ΠΑΑ 2014 – 2020) του Παραρτήματος II της παρούσας, τον έλεγχο των δικαιολογητικών των αιτήσεων πληρωμής βάσει της διαδικασίας Ι.6.4 του Συστήματος Διαχείρισης και Ελέγχου (ΣΔΕ) του ΠΑΑ 2014-2020 (Β’ 1273/2016) και την έγκριση (αναγνώριση και εκκαθάριση) των πληρωμών, για τη χρηματοδότηση των νομικών δεσμεύσεων των δικαιούχων, αναλαμβάνει η Ειδική Υπηρεσία Εφαρμογής Άμεσων Ενισχύσεων και Τομεακών Παρεμβάσεων.